Vatten används av trädet för att transportera näring och mineraler, för att "pumpa upp" cellerna så att de håller formen, som råmaterial för fotosyntesen och genom sin avdunstning som avkylning för bladen. Vatten tas upp av de tunna hårrötterna och pumpas vidare upp till trädets alla levande delar. Ett normalt träd suger 2-300 liter vatten per timme och ungefär 98% avdunstar från löven. Det krävs en avsevärd kraft för att lyfta allt detta vatten till trädets krona. Tre mekanismer samverkar för detta. Rötterna tar upp vatten via osmos och åstadkommer därigenom ett övertryck i rotens centrala celler som är format som tunna transportrör och kallas xylem. Genom kapillärkrafter i dessa "tunna rör" dras vattnet uppåt. Vattnet i bladen avdunstar och skapar därigenom ett undertryck i cellerna som suger upp vatten. Alltså, rötterna trycker, bladen suger och tack vare att transportrören är tunna så hjälper kapillärkrafterna till, snillrikt och enkelt!

Ur bonsaisynpunkt skall man tänka på att jorden aldrig får torka ut helt. Om så sker kollapsar rötternas celler och kan därigenom inte transportera vatten, detta tillstånd är icke reversibelt och roten är död. Givetvis dör trädet om en stor del av rötterna dör. För plantor i små krukor i full sol och blåst så kan det innebära att de behöver vattnas två gånger per dag! Å andra sidan tål inte rötterna att stå i för mycket vatten, förutom att tillväxten blir dålig så finns det risk för att rötterna ruttnar. Med andra ord lagom är bäst!

Eftersom kraven varierar mellan olika plantor så är det svårt att ge några allmänna råd. T.ex. en pil vill ha det mycket blötare om fötterna än en tall. Hur mycket och hur ofta man behöver vattna varierar dessutom med vilken jordblandning man använder. Generellt kan man nog ändå säga att det är bra att vattna rikligt och låta jorden nästan torka ut däremellan. Om man använder en bra jordblandning och dränering i krukans botten, så evakueras vattenöverskottet och man riskerar inte att vattna för mycket.

Det enda tillfället då jag tycker det är en fördel att snåla med vattnet är för tallar på våren och försommaren medan barren utvecklas och sträcker på sig. Kan man åstadkomma en kontrollerad vätskebrist så blir barren kortare. Så snart barren har stelnat och slutat växa kan man vattna normalt igen utan att de sedan växer sig långa.

Även på vintern dunstar vattnet ur jorden, därför kan man ibland behöva vattna. Undvik att vattna kort tid innan det blir frostgrader för att undvika att cellerna sprängs när de just sugit sig fulla med vatten.